Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms