Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RUFY3Q7L099 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms