Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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