Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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