Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms