Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC009152.1-201ENST00000618290 556 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms