Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms