Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdfS4R2K0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms