Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX6Q9UPM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX6Q9UPM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX6Q9UPM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms