Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3Q9QZS0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms