Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD3Q9NY59 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms