Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARHL2Q9NY43 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARHL2Q9NY43 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms