Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM248Q9NWD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms