Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB6Q9NP58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB6Q9NP58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms