Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b2Q9JME5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b2Q9JME5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ap3b2Q9JME5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms