Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZMYND12Q9H0C1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZMYND12Q9H0C1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND12Q9H0C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms