Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc1Q9DB70 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fundc1Q9DB70 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms