Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl55Q9CZ83 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl55Q9CZ83 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms