Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT23Q9C075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT23Q9C075 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT23Q9C075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms