Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf43Q9BQ61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms