Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSUN4Q96CB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
NSUN4Q96CB9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms