Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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CA13Q8N1Q1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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CA13Q8N1Q1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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CA13Q8N1Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CA13Q8N1Q1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA13Q8N1Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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