Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR49Q8IV35 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR49Q8IV35 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms