Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4bp3Q8C7U1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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N4bp3Q8C7U1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
N4bp3Q8C7U1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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N4bp3Q8C7U1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4bp3Q8C7U1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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