Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Liat1Q810M6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Liat1Q810M6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Liat1Q810M6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms