Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARCQ7LC44 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms