Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mvb12aQ78HU3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mvb12aQ78HU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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