Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF40BQ6NWY9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms