Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRNL1Q5VV63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRNL1Q5VV63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms