Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RPRD2Q5VT52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms