Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate2Q3UW31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pate2Q3UW31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate2Q3UW31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms