Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm1123Q1RME4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm1123Q1RME4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm1123Q1RME4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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