Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms