Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALCAMQ13740 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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