Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC3Q13530 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERINC3Q13530 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERINC3Q13530 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms