Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXC1Q12948 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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FOXC1Q12948 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXC1Q12948 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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