Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXF2Q12947 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXF2Q12947 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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