Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTF1Q05048 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms