Protein–RNA interactions for Protein: Q04602

VBA4, Vacuolar basic amino acid transporter 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4Q04602 SLM5YCR024C 1479 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YIL067CYIL067C 2037 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 LYS21YDL131W 1323 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 AIM6YDL237W 1173 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 MRPL7YDR237W 879 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RPT6YGL048C 1218 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YLR366WYLR366W 306 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 CIN4YMR138W 576 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 NRM1YNR009W 750 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 TLG2YOL018C 1194 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 NGL2YMR285C 1548 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 CLA4YNL298W 2529 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 KKQ8YKL168C 2175 nt5.31□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 MKK2YPL140C 1521 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ATG1YGL180W 2694 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GEP7YGL057C 864 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YHB1YGR234W 1200 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ARG3YJL088W 1017 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 NIT3YLR351C 876 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PEX27YOR193W 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 snR189snR189 189 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YPK2YMR104C 2034 nt5.3□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GPA2YER020W 1350 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PRM2YIL037C 1971 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ATG4YNL223W 1485 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 SIT4YDL047W 936 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 LEU5YHR002W 1074 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 CBF1YJR060W 1056 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GMH1YKR030W 822 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RAD10YML095C 633 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 COS3YML132W 1140 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ATG16YMR159C 453 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 TEX1YNL253W 1269 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GLO4YOR040W 858 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 COS2YBR302C 1140 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 TNA1YGR260W 1605 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RAD24YER173W 1980 nt5.29□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ADE12YNL220W 1302 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 CAB1YDR531W 1104 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 DCD1YHR144C 939 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RPL10YLR075W 666 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YLR365WYLR365W 333 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GSP2YOR185C 663 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YME1YPR024W 2244 nt5.28□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YJR026WYJR026W 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YJR028WYJR028W 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YAR010CYAR010C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YML040WYML040W 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YMR051CYMR051C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 TEC1YBR083W 1461 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 GYP1YOR070C 1914 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 AFT1YGL071W 2073 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PEX19YDL065C 1029 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 GIC2YDR309C 1152 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 KEG1YFR042W 603 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YGR219WYGR219W 342 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YAL064WYAL064W 285 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RPS0BYLR048W 759 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 ECM19YLR390W 339 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YNL303WYNL303W 348 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 snR19snR19 568 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 KTR3YBR205W 1215 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RER1YCL001W 567 nt5.27□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 BUD14YAR014C 2130 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PRI2YKL045W 1587 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SFB3YHR098C 2790 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 BUD30YDL151C 582 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 UBC1YDR177W 648 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CAB4YGR277C 918 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YKL071WYKL071W 771 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR049CYLR049C 1287 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YOL131WYOL131W 327 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CKB2YOR039W 777 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 THI80YOR143C 960 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CPA1YOR303W 1236 nt5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73 ms