Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BNC1Q01954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNC1Q01954 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms