Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS29P62273 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS29P62273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS29P62273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS29P62273 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS29P62273 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS29P62273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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