Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP1P56715 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RP1P56715 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP1P56715 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP1P56715 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP1P56715 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP1P56715 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP1P56715 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP1P56715 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP1P56715 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP1P56715 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP1P56715 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RP1P56715 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RP1P56715 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP1P56715 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP1P56715 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RP1P56715 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP1P56715 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RP1P56715 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP1P56715 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP1P56715 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP1P56715 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP1P56715 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP1P56715 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP1P56715 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP1P56715 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP1P56715 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP1P56715 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP1P56715 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP1P56715 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms