Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLD1P28340 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLD1P28340 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLD1P28340 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLD1P28340 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLD1P28340 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLD1P28340 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLD1P28340 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLD1P28340 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLD1P28340 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLD1P28340 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLD1P28340 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLD1P28340 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
POLD1P28340 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
POLD1P28340 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLD1P28340 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD1P28340 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD1P28340 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD1P28340 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD1P28340 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLD1P28340 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLD1P28340 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLD1P28340 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLD1P28340 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLD1P28340 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLD1P28340 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLD1P28340 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLD1P28340 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLD1P28340 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLD1P28340 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLD1P28340 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLD1P28340 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLD1P28340 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLD1P28340 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLD1P28340 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLD1P28340 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLD1P28340 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLD1P28340 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLD1P28340 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLD1P28340 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLD1P28340 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLD1P28340 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLD1P28340 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms