Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB8P17481 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms