Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA6P17066 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA6P17066 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA6P17066 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA6P17066 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA6P17066 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA6P17066 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA6P17066 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSPA6P17066 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms