Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms