Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTNP04004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTNP04004 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTNP04004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTNP04004 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTNP04004 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTNP04004 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTNP04004 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTNP04004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTNP04004 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTNP04004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTNP04004 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTNP04004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTNP04004 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTNP04004 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTNP04004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTNP04004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTNP04004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTNP04004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTNP04004 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VTNP04004 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTNP04004 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VTNP04004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTNP04004 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms