Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGAP02671 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGAP02671 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGAP02671 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGAP02671 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGAP02671 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGAP02671 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGAP02671 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGAP02671 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGAP02671 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGAP02671 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGAP02671 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGAP02671 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGAP02671 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGAP02671 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGAP02671 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGAP02671 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGAP02671 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGAP02671 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms