Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHAP00338 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHAP00338 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHAP00338 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHAP00338 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHAP00338 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHAP00338 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHAP00338 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHAP00338 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHAP00338 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHAP00338 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHAP00338 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDHAP00338 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDHAP00338 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDHAP00338 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDHAP00338 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDHAP00338 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms