Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp100O35892 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sp100O35892 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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